DNA² 미래에서는 인구 증가가 가장 심각한 사회 문제. 그런 속에서 100명의 자식을 남긴 메가 플레이보이 (모모나리 쥰타) 의 유전자는 독버섯과도 같은 존재다. 이 유전자를 없애기 위해 특별히 파견된 요원 아오이 카린. 스스로 일류라 자부하며 미래 계획까지 세워놓은 귀여운 그녀, 하지만 그녀가 과거의 세계로 와서 발견한 모모나리 쥰타는 도저히 훗날 메가 플레이보이가 될 사람으로는 보이지 않는 평범한 남학생이었다. 오히려 여학생 앞에서 진정하지 못해서 구토를 할 정도로 한심한 고등학생인 모모나리 쥰타. 그러나 그런 그도 어렸을때부터 소꿉친…